【生物谷】华南农业大学：miRNA介导病毒与水稻互作

  作者：生物谷来源：生物谷2014-8-6 17:24:05

    南方水稻黑条矮缩病毒（SRBSDV）是最近出现的一种水稻病毒，已经蔓延整个亚洲。这种毁灭性的病毒引起水稻植株在不同生长阶段，产生各种症状。microRNA（miRNA），一群21-24 nt的RNA分子，是植物发育过程和应激反应过程的重要调节剂。SRBSDV感染必然会影响水稻miRNA的表达丰度，然而，尚未有报道说明这种新出现的病毒与宿主miRNA之间的相互作用。华南农业大学的周国辉教授带领的研究团队探讨了miRNA调节水稻SRBSDV感染应答的机制以及水稻病毒疾病的发病机理*，研究成果发表在7月刊的Virus Research上。

    研究人员选取了接种病毒3，9，15和20 dpi（days post-inoculation）四个时间点，利用miRNA微阵列分析（芯片分析项目由联川生物承担完成）确定各时间点水稻受SRBSDV感染后，miRNA应答表达模式。结果显示，水稻植株中56个miRNA的表达水平发生了改变，这些变化根据各自的时间表达动力学可归类到八个不同的调节模式。来自6个miRNA家庭（miR164，R396，R530，R1846，R1858和R2097）的14个miRNA在20dpi被显着调节。研究人员用RT-qPCR检验在3，9和15 dpi，这些家庭成员和它们假定靶基因之间表达水平的相关性。miR164，R396，R530和R1846家族的一些成员被发现与各自的靶基因在SRBSDV感染后3至15days时的表达水平存在正相关或负相关，而在更多的情况下，水稻miRNA与它们的靶基因在接种后的阶段是不相关的，这表明一些另外的因素可能介入了水稻的miRNA与靶基因之间的相互作用。

    由miR164，R396，R530，R1846和R1858家族靶向结合的水稻基因的功能显示，这些基因与症状的发展有关。这些结果有助于深入了解miRNA介导的SRBSDV与水稻的相互作用，进一步阐明水稻miRNA表达与调控的复杂网络和分子机制。（生物谷Bioon.com）

    Donglin Xu， Guiping Mou， Kang Wang， Guohui Zhou MicroRNAs responding to southern rice black-streaked dwarf virus infection and their target genes associated with symptom development in rice (2014) Virus Research 190(22)： 60-68 doi： 10.1016/j.virusres.2014.07.007 [article]

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