夏瑞课题组发表高水平论文 揭示miRNA介导基因沉默的调控新机制
近日,我校亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、园艺学院青年千人计划入选者夏瑞教授课题组和李建国研究员课题组在国际著名学术期刊New Phytologist(IF=7.330)发表题为“Coupling of microRNA-directed phasiRNA generation from long noncoding genes with alternative splicing and alternative polyadenylation in small RNA-mediated gene silencing”的研究论文。(在线网址 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.14934/abstract;jsessionid=E0566F39BF50E8ED7D99440936353EAF.f03t01
该研究通过小RNA测序,降解组测序和转录组测序,结合生物信息学分析以及分子生物学实验,对荔枝miRNA和phasiRNA的调控通路进行了全基因组鉴定,发现在荔枝中miRNA可以耦合可变剪切/选择性多聚腺苷化诱发不同转录本区域内phasiRNA的产生,进而介导基因沉默的调控通路。
荔枝中主要miRNA家族及靶基因
miRNA耦合可变剪切选择性多聚腺苷化生成phasiRNA并介导基因沉默的模型
该论文的第一作者为园艺学院的博士生马武强,通讯作者为夏瑞教授和李建国研究员。本研究受到国家自然基金、中组部青年千人人才计划、农业部优秀人才计划,广东省教育部创新团队项目和荔枝龙眼产业体系专项等项目的支持。(亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室 杨瑞春)
(责任编辑:蒙丽)