“银杏全基因组测序及重要基因挖掘研究”正式启动

中国林业网8月3日讯     7月24日，林业公益性行业科研专项重大项目“银杏全基因组测序集重要基因挖掘研究”启动会在南京召开。

该项目由南京林业大学和中国农业科学院深圳农业基因组研究所共同承担。项目组以银杏单倍体胚乳为研究材料，开展银杏基因组测序和控制重要性状基因解析研究，主要研究内容包括全基因组图谱构建、基因注释及其常规基因组分析、基因组重要基因资源挖掘。主要研究目标为：采用第二代和第三代测序平台相结合的策略，开展全基因组De Novo测序和组装，估测基因组大小，分析测序深度及基因覆盖度；完成银杏全基因组Repeat注释、基因注释、基因功能注释和ncRNA注释；完成银杏基因组基因家族鉴定分析，构建出物种系统发育树，分析全基因组复制事件，估算出物种分化时间；分析裸子植物与被子植物在基因结构、密码子使用偏好等方面的差异，从分子水平上阐明银杏在生物进化中的特殊地位；发掘控制银杏黄酮和内酯等重要次生代谢产物合成的结构基因与调控因子，构建完整的银杏重要次生代谢产物合成代谢途径和调控网络。

会议听取了项目负责人关于项目意义、目标、内容、实施方案等情况的汇报，与会专家围绕项目实施过程中可能存在的问题、难点、方法和成果等进行了交流和讨论，并提出了建设性的建议。

启动会由南京林业大学科技处主持，邀请中国林科院、北京林业大学、中南林业科技大学、扬州大学等相关院校的专家参加了启动会，国家林业局科技司派员参加了启动会并提出了具体要求和建议。